Els Estatuts del CAT, publicats al Diari Oficial de la Generalitat de Catalunya, estableixen la forma de govern del Consorci i, en aquest sentit, delimiten les competències de l’Assemblea General, el Consell d’Administració i el president de la institució.
L’Assemblea General es reuneix com a mínim dos cops a l’any. Té entre altres atribucions l’aprovació del pressupost anual del Consorci, que suposa la tarifa que aplicarà el CAT pel servei, els plans d’obres i els comptes anuals. Està formada per un representant de cadascuna de les indústries i ajuntaments consorciats, i nou representants de la Generalitat, dels quals dos són proposats per comunitats de regants dels marges esquerre i dret del riu Ebre.
Les competències executives del Consorci recauen en el Consell d’Administració. Aquest organisme està format per dos representants de la Generalitat, dos de les Comunitats de Regants, dos de les indústries i dos dels municipis: el que té més consum d’aigua i un altre escollit entre la resta d’ajuntaments. Aquest òrgan pren decisions sobre el dia a dia de la gestió del Consorci, l’organització i la contractació d’obres i serveis.
El president, per la seva part, és nomenat pel conseller de la Generalitat del ram entre tots els membres de l’Assemblea. Entre altres funcions, presideix l’Assemblea, fa complir els acords presos i representa judicialment i administrativament el Consorci.
